摘要：本发明公开了一种面向分子动力学模拟的异构节点静电力计算装置，包含：CPU节点，用于构建分子拓扑结构，计算高斯宽度参数，初始化短程力查询表，并在模拟结束后输出原子运动轨迹与系统能量；FPGA节点，通过PCIe总线与CPU节点连接，用于依据截断半径及原子坐标筛选短程原子对，并以查询表方式并行计算短程静电力；GPU节点，通过同一PCIe总线与FPGA节点及CPU节点连接，用于对全体系原子执行长程静电力计算，并将短程力与长程力归约后更新原子位置与速度。本发明提供的面向分子动力学模拟的异构节点静电力计算装置，通过合理的任务分配，充分利用GPU和FPGA的优势，实现GPU和FPGA的异步并行计算，提高静电力计算的整体速度。